商代甲骨文中出现的各种血缘或地缘组织名称约550个。其中有方国51个，方伯名40多个。 商代的疆域由两部分组成：（1）核心国土，商王室直接治理的地方；（2）附属国，归顺商朝的各部族的自治领地。商王直接治理的核心国土称为中土、大邑商，地位就相当于前苏联的俄罗斯。中央参与决策的官员叫做“尹”、“多尹”，古汉语中“尹”有治理、管理的意思；执行商王命令的官员叫做“臣”、“小臣”，比如负责农业的叫“藉臣”；而负责具体某一事物的叫做“正”，比如掌管畜牧业的“牧正”。
各部族的自治领地在核心国土的周围，称为方、四土，是商的附属国。其地位相当于前苏联的乌克兰、立陶宛、哈萨克斯坦等加盟共和国。附属国原来多是独立的酋长国，被商征服后臣服于商，商王册封原来的酋长为“邦伯”进行管辖。“伯”在古汉语中有最大、头领的意思，其实就是酋长。这些邦伯分为侯、伯、田、男、卫等几个等级。甲骨文中的侯有近50个，包括仓侯、告侯、专侯、舞侯、犬侯、杞侯等。
商王朝是一个以商族为中心的宗族联盟，因此方国与大邑商的关系与后世的朝廷与地方的关系有很大区别的。商代各方国都不是“纯臣”。各方国对商王时叛时服，在事实上处于半独立的地位。王国维曾说：“殷以前，天子诸候之分未定也”。大邑商与各方国之间实际上只是大族和小族的关系。联盟关系的建立就是大族对小族的武力威慑。 从甲骨文卜辞来看，大邑商对其他方国的态度有两种：一是相互依存，一是凌驾控制。卜辞中的“比”字,在古代是联合的意思。殷卜辞中常见“王比某方伯”或“王比某伐某”的记录，如：“贞，王比兴方伐……”，“乎比丹伯？勿乎比丹伯？”，“乙酉卜……令多子族比犬侯扑周甾？”。这类卜辞都和战争有关，说明商代是大邑商和各方国的联盟型国家。 另一方面，大邑商与方国间是不平等关系。卜辞表明，商王不仅“比”其他方国，有时也“令”其他方国。如：“癸卯卜，宾贞……令沚方？”“庚辰，贞，令望方？”“癸亥，贞，王令囗侯伐……”这里的“令”，显然是一种指挥与服从的关系。 大邑商还通过联姻，强化与各方国之间的政治关系。各方国也经常嫁女子与商族结亲，这种结亲有的是自愿，也有的是被迫的。如卜辞记载：“呼取女于婪”“呼取郑女子”等。商王族女子也要外嫁其他方国。如《易经》中记载：“帝乙归妹。”。《诗·大雅·大明》中记载：“大邦有子，伣天之妹，文王厥祥，亲迎于渭。”商王帝乙把邦中女子嫁给周文王，就是用通婚来维系商和周的关系。
商代中丁以后，王族内部为权力纷争不断，被称为“比九世乱”。王族成员争夺王权最常用的一种方法就是迁都，把政治中心迁徙到自己的核心领地内。这导致当时商朝平均每20年迁都一次，统治开始混乱。至盘庚时，宗族内部的斗争又进一步恶化。雄才大略的盘庚最终打败了其他王位争夺者，并把殷都迁到安阳，商朝开始了全盛时期。
