虫草花的主要有效成分是虫草素、虫草多糖、虫草酸、不饱和脂肪酸、氨基酸、多肽、生物碱、抗菌活性物质以及微量元素等。到目前为止，医学上没有证实这些成份在合理剂量下长期作用于人体会产生耐药性以及其他副作用。
但要注意两点：
1、忌食生虫草花 虫草花比较特别，是一种长在泥土中的中药，在采挖时其表面会存在较多的寄生虫、真菌以及活虫卵，即使用开水来冲泡也难以将其全部杀死，因此建议大家尽量避免使用生的虫草花，以免引发感染，继而损害自身的健康。
2、不吃发霉的虫草花 如果由于保存不当而使虫草花出现了发霉的情况，此时应注意避免食用此类发霉的虫草花。虽然目前尚未有权威性的临床试验证实发霉的虫草花会给人体造成哪些危害，但是发霉的虫草花其药效已经大大降低，如果食用了这种发霉的虫草花可能还会产生其他副作用。
