即使是在三体这本书的设定中，黑暗森林体系也并不是合理的，这只是地球人和三体人这种低级文明对宇宙的猜想，而更真实的情况大刘是在三体第三部的靠近结尾的地方讲过。按照书中的设定，所谓的“黑暗森林”只是宇宙中更高级文明之间战争的副产物。就像在地球上的两个国家发生战争的时候平民误触雷的情况时有发生，在战场上随便露头的人会被顺手清理掉一样。究其根本，书中的人类文明这个级别会受到“黑暗森林”的影响只是因为他们太弱小了，一只飞虫被顺手打死是不需要任何理由的。
简而言之，黑暗森林理论对书中人类这个级别的文明来说足够“正确”，但是罗辑的推理过程完全错误
