利比里亚独立后的10多年里，美国各州仍陆续送来自由黑奴，但数量急剧下降，因为更激进的黑奴解放运动已风起云涌，原本支持美国殖民协会的一些政治家，如林肯，也迅速转变立场。1861年4月，南北战争爆发，次年9月22日，林肯总统颁布《解放黑奴宣言》，黑奴在全美范围内获得了理论上的公民权力，美国殖民协会基于“种族内平等”和黑奴制度依旧存在而制定的移民计划，至此已完全不合时宜，大规模、有组织的移民活动就此无疾而终。
从1820年到1867年，47年间从美国出发去利比里亚的自由黑人不过1.3万多，仅占美国黑人总数的2.6%，占利比里亚总人口2.5%，美国殖民协会希望借此隔绝黑白人种的设想可谓完全失败。不仅如此，“自由国”既未给美国自由黑奴带来真正的自由和幸福，又人为造成和土著黑人的尖锐矛盾，这一矛盾在此后100多年里一直困扰着利比里亚。美国黑人后裔顽固把持政权，对土著采取一系列歧视和不平等政策，直到1980年4月12日，占总人口95%以上的土著黑人才第一次掌权，此时距利比里亚独立已有近132年。而通过血腥政变上台的土著多伊政权随即对前政府展开残酷报复。
