合作市人民政府是甘肃省合作市的国家行政机关，属县级市行政级别，作为市人民代表大会的执行机关，依法履行经济调节、市场监管、社会管理等职能，对市人大负责并报告工作 。该政府实行市长负责制，现任市长为石成娟，下设直属部门包括市政府办公室、发展改革局、教育局等，并管辖坚木克尔街道办等派出机构 。
2025年一季度全市GDP达19.03亿元，同比增长4.1%，实施提振消费专项行动推动社会消费品零售总额增长目标6.8%以上 。政府通过科技支持推动青稞深加工全产业链转型，2024年相关企业销售额达1091万元 。机构运行遵循《合作市人民政府工作规则》，推进数字政府建设及政务公开，下设部门包含卡加曼乡政府等基层单位 。生态保护方面承办省级草原普法活动，构建草原保护共治格局 。
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