《2016年度国家自然科学基金项目指南》由国家自然科学基金委员会编著，科学出版社2016年出版，ISBN号为9787030468680 。该书依据《国家自然科学基金条例》及相关管理办法，明确了2016年度基金申请须知、限项申请规定及各类项目资助政策，为科研工作者申请基金提供规范性指导。 2016版申请书及“条例”、“指南”、管理办法均可在基金委网站下载或查阅，各类项目申请经费分为直接费用和间接费用两部分，《指南》所列资助强度为直接费用与间接费用之和。
全书系统介绍研究项目系列、人才项目系列、环境条件项目系列的具体申报要求。面上项目支持科学技术人员在资助范围内自主选题，开展创新性科学研究，申请人应当具有高级专业技术职务(职称)或者具有博士学位。青年科学基金项目支持青年科学技术人员自主选题开展基础研究，申请当年1月1日男性未满35周岁、女性未满40周岁。 书中附有国家自然科学基金申请代码表与各学部项目分类细则，并收录NSFC-广东联合基金、石油化工联合基金及“大数据驱动的管理与决策研究”重大研究计划专项指南。 其中，NSFC-广东联合基金在先进材料与智能精密制造、人口与健康、管理科学3个领域组织申报，包括重点支持项目和集成项目，重点支持项目合作研究单位的数量不得超过2个，集成项目合作研究单位的数量不得超过3个。 申请人应认真阅读《指南》及相关管理办法，登录科学基金网络信息系统在线撰写和提交申请书。 该书为当年基金资助工作的官方依据文件及申请人必读文献。
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