邦嘎新石器时代遗址位于西藏自治区山南市琼结县下水乡邦嘎村，地处琼结河东岸二级台地，海拔3700米左右，现存面积约3000平方米。遗址于1985年由西藏自治区文物管理委员会发现并试掘50平方米，2000年起中国社会科学院考古研究所联合西藏文博机构开展多次考古发掘 。
遗址出土陶器以夹砂灰陶、灰褐陶为主，含红、灰、黑三种陶片，器形包括罐、钵、盆等；发现打制与磨制石器186件，主要为磨盘、磨石等工具 。清理出方形石墙房屋基址及四座圆形灰坑，其中四座石砌灰坑推测为祭祀遗迹 。出土动物骨骼分析显示存在家养黄牛、牦牛及其杂交种，600余片羊骨骨片可能为骨器原料；古DNA研究证实黄牛基因组与我国西北古代黄牛高度相似 。遗址发现青稞等植物遗存，表明农牧结合的生业模式 。
考古研究表明遗址主体年代为距今3000-2000年，属新石器时代晚期曲贡文化系统，与曲贡遗址、昌果沟遗址共同构成雅鲁藏布江中游史前文化序列 。
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