1937年，抗日战争全面爆发，南京失陷后，国民党政府被迫迁至陪都重庆。在这个动荡时期，重庆的情报机构惊人地截获了大量密电，这些从重庆发往日本空军的神秘信号，预示着不祥之事。日军飞机突然空袭重庆，中国空军在试图拦截时遭遇重创，失去了对空的控制。中央高层意识到，日军的空袭与这些新密码有直接关联，他们急需破译密码，揪出隐藏的间谍。然而，当时的中国技术难以破解电台密码，于是寻求美国密码专家雅德利的帮助，但雅德利当时身处日军占领的武汉。重庆政府决定建立自己的密码情报机构，派遣中共党员特工秦骜前往武汉，目标是夺回这位被誉为“密码之父”的美国专家。在武汉，秦骜与陆涯合作，成功从日军手中救出了雅德利，他们一起前往重庆的谍报机构——黑室，投入到紧张的工作中。在武汉，秦骜意外重逢了已加入地下党的未婚妻扈渝雯，她此刻已是陆涯的妻子。为了揪出隐藏在黑室的内奸“独臂大盗”，他们策划了一次钓鱼行动。尽管陆涯是唯一的幸存者，他因此被怀疑为内奸，但他选择逃亡，追踪可疑线索。在一系列的追踪与考验后，陆涯终于揭示了真正的“独臂大盗”。然而，重庆高层中还潜藏着更大的日奸，酝酿着更险恶的阴谋。为了国家的安危，陆涯不惜牺牲自己的生命，揭露并挫败了敌人的阴谋，成功保卫了重庆的安全。
